L'any 300X la Terra cau sota el domini del malvat quart emperador de la dinastia Calba-lluent. Per a afermar el seu poder decideix crear un exèrcit de Rapadors, que es dediquen a rapar el cap a gent de tot el món. En Bobobo, que des de menut va tenir l'especial habilitat de comunicar-se amb el pèl de la gent i fins i tot amb el seu propi, es veu empès a lluitar contra ell i pren el pseudònim de "El llibertacabelleres". Amb l'ajuda de personatges igual o més estrafolaris que ell anirà derrotant a les diferents divisions de l'exèrcit del malvat emperador fins a crear un món en el qual el pèl de la gent pugui ser lliure.