El Dr. No, un malvat científic, i en Xip, un nen de 9 anys simpàtic i eixerit, són enviats pel raig d'un accelerador de partícules al món atòmic, el Micromón. El Dr. No, obsessionat per dominar el món, construirà un exèrcit d'antimatèria i una gran màquina anomenada Torre Negra, però perquè funcioni necessita una lent que, per casualitat, ha caigut a mans d'en Xip. El malèfic científic perseguirà el nostre heroi per tot el Micromón per aconseguir-la, però en Xip, ajudat pels seus inseparables amics, en Merc, en Fer i l'Hidro, viurà grans aventures per arruïnar-li els plans i aconseguir tornar a casa.