Tracta d'un ninja, Hanzo Hattori, que ve d'Iga, a la ciutat on viu Kenichi, un nen que no confiava en si mateix, Hattori tria a Kenichi per ser el seu amo. Al costat de Shinzo, el seu germà, i Shishimaru, el seu gos ninja, que fan coses meravelloses, tècniques, comportaments, habilitats ninja, etc., amb Kemuzo Kemumaki, ninja de Koga, que sempre lluita amb Hattori i es fica amb Kenichi, Shinzo i Shishimaru.